bip svgeurope svg facebook svgyt svgbip svg
bip svgeurope svg facebook svgyt svgbip svg

Zakład Diagnostyki Molekularnej

Telefon(41) 367-42-58
Opracowywanie wyników(41) 367-42-56, (41) 367-42-58
przyjmowanie materiału(41) 367-42-57
E-mail Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
E-mail - KierownikTen adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
 

Kierownictwo zakładu

avatar
Kierownik:
dr hab. n. med. Artur Kowalik, prof. UJK

specjalista laboratoryjnej genetyki medycznej
oraz medycznej genetyki molekularnej,
konsultant wojewódzki w dziedzinie laboratoryjnej genetyki medycznej


Z-ca kierownika:
dr n. med. Małgorzata Chłopek 
specjalista laboratoryjnej genetyki medycznej
E-mail: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. 


 

Działalność medyczna

W Zakładzie Diagnostyki Molekularnej wykonujemy badania technikami biologii molekularnej na potrzeby pacjentów leczonych w ŚCO. Wykonywane badania można podzielić na trzy główne typy:

  • wykrywanie predyspozycji dziedzicznych do rozwoju chorób nowotworowych (np. BRCA1) – realizowane w ścisłej współpracy z Poradnią Genetyczną ŚCO,
  • stratyfikacja pacjentów do terapii celowanych (rak jelita grubego – KRAS, NRAS; czerniak – BRAF; niedrobnokomórkowy rak płuca – EGFR; rak jajnika, rak piersi, rak trzustki, rak prostaty – BRCA1/2),
  • diagnostyka i monitorowanie skuteczności leczenia w nowotworach hematologicznych (np. CML, ALL, AML, PV i inne).
W skład zakładu wchodzi również BIOBANK ŚCO, który służy gromadzeniu materiału do badań naukowych.
 

Wykorzystywane techniki

Technika
Masywne równoległe sekwencjonowanie (next generation sequencing – NGS)
Sekwencjonowanie kapilarne
MLPA, MSi
qPCR, PCR, RT-PCR, PCR-HRM
Digital PCR

 

Działalność badawcza

Działalność badawcza koncentruje się wokół poszukiwania nowych genów dla diagnostyki i terapii nowotworów z użyciem m. in. techniki NGS. Prowadzimy również badania dotyczące wykorzystania pozakomórkowych kwasów nukleinowych (cfNA) jako źródła materiału diagnostycznego – tzw. „liquid biopsy". Rozwijane są również badania dotyczące hodowli oraz zastosowania limfocytów naciekających guz nowotworowy (TILs) w terapii komórkowej chorób.


 

Współpraca naukowo-badawcza

Instytucja / OsobaZakres współpraci
Polska
PIB-NIO Warszawa
Prof. dr hab. n. med. Magdalena Kowalewska
Analiza biologii nowotworów ginekologicznych
PIB-NIO Kraków
Prof. dr hab. n. med. Janusz Ryś
Biologia mięsaków oraz nowotworów piersi
Instytut Wysokich Ciśnień PAN
Prof. dr hab. Jan Weyher
Wykorzystanie podłoży SERS do ultraczułej diagnostyki
Wydział Chemii, UW
Prof. dr hab. Andrzej Kudelski
Zagranicy
Laboratory of Pathology, National Cancer Institute, NIH
Bethesda, MD, USA
Dr Jerzy Lasota
Biologia molekularna nowotworów – GIST, czerniak, rak jelita grubego
 

Personel

Imię i nazwiskostanowisko
dr hab. n. med. Artur Kowalik kierownik zakładu
dr n. med. Małgorzata Chłopek z-ca kierownika, diagnostyk laboratoryjny
Diagności laboratoryjni
mgr Anna Fatyga młodszy asystent diagnostyki
mgr Krzysztof Gruszczyński młodszy asystent diagnostyki
mgr Iwona Hraj młodszy asystent diagnostyki
mgr Kamila Kubicka młodszy asystent diagnostyki
mgr Ewelina Nowak-Ozimek młodszy asystent diagnostyki
mgr Elżbieta Wypiórkiewicz młodszy asystent diagnostyki
mgr Liliana Zięba młodszy asystent diagnostyki
dr n. med. Sebastian Zięba starszy asystent diagnostyki, specjalista medycznej genetyki molekularnej
Biolodzy, biotechnolodzy
mgr Magdalena Baćkowska młodszy asystent
dr n. med. Kinga Hińcza-Nowak asystent
mgr Katarzyna Korban młodszy asystent
mgr Karol Krawczyk młodszy asystent
mgr Dominika Ksel młodszy asystent
dr Justyna Miłek-Krupa asystent
mgr inz. Patryk Nowakowski młodszy asystent
mgr Angelika Odej młodszy asystent
mgr Magdalena Stawiarz młodszy asystent
mgr Magdalena Lipiec młodszy asystent
mgr Magdalena Tyka młodszy asystent
Pozostali pracownicy
Dominika Walkowicz sekretarka medyczna
Małgorzata Kwiecińska pomoc laboratoryjna
  • CLC
  • Elektroforeza 1
  • FinchTV   Chromatogram [delecja Z Zaznaczeniem]
  • IGV
  • L 11
  • L 17
  • L 21
  • L 23
  • L 25
  • L 26
  • L 27
  • L 29
  • L 3
  • L 33
  • L 5 01
  • L 9
  • MAXWELL 2
  • MLPA Delecja BRCA1
  • Aviti
  • Maxwell3